6月26日，中国疾病预防控制中心官网发布的《2020年6月北京新型冠状病毒肺炎疫情进展》称，北京本次疫情流行的新冠病毒为L基因型欧洲家系分支Ⅰ，排除动物病毒外溢和武汉流行毒株导致的可能性。大规模人群检测结果提示，与新发地批发市场无关的人群感染率极低，北京疫情近期有望得到控制。

　　《疫情进展》显示，北京本次疫情流行的新冠病毒为L基因型欧洲家系分支Ⅰ，该毒株比当前欧洲流行同型毒株更“老”；可以排除由动物病毒外溢传染人，也排除今年4月前北京本地传播毒株或武汉流行毒株导致本次疫情。疫情在新发地批发市场的传染模式，推测主要为人与人之间直接接触传播和/或经物品表面污染的间接接触传播。此外，6月17日，天津报告1例本地感染的确诊病例，其病毒基因序列与北京本次疫情流行的新冠病毒完全相同，其传染来源仍在调查中。

　　《疫情进展》称，疫情发生后，专业机构快速确认本次疫情的主要感染来源为新发地批发市场，北京市各级政府快速采取强力的防控措施。自6月13日关闭新发地批发市场以来已有十多天，接近新冠肺炎最长潜伏期，相关暴露人员发病风险越来越低，其密切接触者也在有效管理中，预计新发地批发市场相关传播的疫情已基本得到控制。

　　虽然最近发现若干与新发地批发市场无关联、感染来源尚待进一步调查的病例，提示后续防控可能存在一定的复杂性，但北京开展大规模人群检测结果提示，与新发地批发市场无关的人群感染率极低。目前，国家卫生健康委已协调全国12个省20支核酸检测队支援北京，调配移动P3实验室，动员增加实验室建设，同时协调天津、河北分担北京部分检测任务。