在美洲热带地区，甲流传播最活跃的地区仍为加勒比海部分地区。在古巴，自2月末起甲流病毒开始了第二轮活跃的社区传播，4月末达到高峰，后开始下降；此次传播，尽管出现了重症和死亡病例，但整体上比2009年9月末至11月末的第一轮传播强度低。相反，在多米尼加共和国，低强度的呼吸疾病主要与呼吸病毒有关，而非流感病毒；仅报告了散发的季节性流感病毒。低水平的甲流病毒在中美洲和南美洲热带地区传播，如2009年12月起在墨西哥，2010年初起在哥伦比亚和巴西，以及2010年4月初起在危地马拉。尼加拉瓜和洪都拉斯近期也报告了流感病毒的局部传播，但目前还不清楚季节性流感、甲流和其他呼吸病毒所占的比例。相反，在巴拿马，过去三个月，低水平的呼吸疾病主要与流行的呼吸病毒有关，而非流感。2月末至3月初，玻利维亚经历了一段低水平但持续的季节性乙型流感传播。来自该地区多个国家的证据显示，出现了流感与其他呼吸病毒（包括呼吸道合胞病毒及腺病毒）的同时传播。