儿童肥胖因其与成年期的多种疾病有关, 所以越来越引起人们的重视, 其发病机制涉及到激素、受体、脂肪代谢等多方面因素。单纯性肥胖对儿童心血管功能有潜在的危害, 是成人肥胖症、心血管疾病的危险因素。
3.1.1 智力下降 
         肥胖影响脑细胞增殖，造成大脑沟回变浅、皱褶变少、神经网络简单化等恶果，医学上称为肥胖脑。肥胖脑表现为倦怠嗜睡、反应迟钝、记忆力与思维能力下降。

3.1.2 高血压 
         原发性高血压已不再是成人的专利，而且随着肥胖儿童的增多还不断攀升。
         近几年国内几个城市的调查表明：血压偏高者，6岁时仅为0.5%，而到14 岁时升至9.36%，超重儿童高血压的发生率为正常儿童的3倍多。

3.1.3 糖尿病 
         近年来，由于国人的生活方式逐渐“西化”，肥胖儿童的队伍迅猛“扩军”，儿童糖尿病发病率大幅攀升，“小糖友”日渐增多已是不容忽视的现象。

3.1.4 脂肪肝 
         正常情况下肝脏里也含有脂肪，但比例较小，一般约占肝脏湿重的5%。如果脂肪侵袭肝脏，充填肝细胞，将肝细胞挤到一边，造成肝细胞脂肪变性，使肝内脂类含量超过肝脏湿重的10 % ～15 % ，或者在组织学上脂类含量达到肝重4 0 % 甚至50% ，就成了脂肪肝。

3.1.5 乳房增大 
         肥胖导致脂肪堆积，而脂肪细胞能将雄激素转化为雌激素。换言之，胖孩子体内的雌激素明显增多，从而促进乳房发育，致使乳头女性化而增大。

3.1.6 骨关节病 
         肥胖儿体重过重，导致下肢关节压力过大，致使关节难以承受身体的压力，因而出现腿脚疼痛。另外，一些胖孩子还伴有骨密度减低的状况，个别患儿甚至出现了骨骼病变。由于人在运动尤其是剧烈运动时，身体对关节的压力可增加到体重的5～6 倍，故关节疼痛的孩子要避免剧烈运动，以防发生骨折等意外。同时，胖孩子的骨头脆性也增大，发生再次骨折的几率也比较高。
         椎间盘是个垫状、含水分比较多的弹性结构，随着压力的增大，厚度将变薄，当变薄到一定程度时就向四周膨出，如果向后膨出就会压迫神经，引起腰腿疼痛等症状。由于肥胖少年的体重大，压力也相对大，故发生腰椎间盘膨出的几率比起正常体重的孩子高很多。
         儿童肥胖还可能对足部造成持久伤害。当脚所承受的重量和压力增加时，脚的结构可能发生改变。孩子的脚骨远未发育完全（脚骨发育完全的时间为：女孩14～15 岁，男孩15～17 岁），比较容易变形，7～9 千克的赘肉就可以使足弓变平，造成脚后跟的生长板发炎。更糟糕的是肥胖儿童的足病可能引起恶性循环，如脚部疼痛造成活动困难，而不活动又使足病难以得到矫正。
         很多肥胖儿童出现膝外翻、股骨头坏死等疾病

3.1.7 个子矮小 
         肥胖可使骨骼发育超前，造成骨骺提前闭和（可提前闭和3 ～5 年），而骨骺一旦闭和，骨骼的生长便告终止，身高也不长了。换句话说，胖孩子的骨骼生长较正常儿童少了好几年，自然矮小。

3.1.8 性异常 
         肥胖儿童的性发育也常受到牵连，出现诸如小阴茎、小睾丸、第二性征缺乏等性异常。原因为，当脂肪在皮下逐渐堆积时，内脏器官的细胞也在悄悄地“脂肪化”，控制生长发育的脑垂体细胞也被脂肪细胞代替，由此造成性激素分泌紊乱，男性荷尔蒙减少，而雌激素水平增高，上述性异常征象便陆续出现，导致成年后性无能或丧失生育能力。